V obci se nacházejí tři stanoviště sběrných nádob na tříděný odpad, kam je možné ukládat:
- PAPÍR do sběrné nádoby modré barvy,
- SKLO do sběrné nádoby zelené nebo bílé barvy,
- PLASTY do sběrné nádoby žluté barvy.
V lokálním sběrném místě u čistírny odpadních vod je možné ukládat do přistaveného kontejneru ŽELEZNÝ ODPAD. Sběrné místo je otevřeno kromě ledna každou první středu v měsíci od 15.00 do 16.00 hodin. Vstup v jinou dobu je možné sjednat na obecním úřadě (tel. 312 698 813).
Dvakrát ročně je organizován svoz velkoobjemového a nebezpečného odpadu, o kterém obec informuje prostřednictvím Malokyšických ozvěn a vývěsních tabulí.
Na obecním úřadě lze sjednat pravidelný svoz bioodpadu z domácností. Svoz probíhá od dubna do konce listopadu.